/users/218819/scratch/projects/HantaVirus/PhaME/results/Hantaan_virus_76_118_norepeats.fna /users/218819/scratch/projects/HantaVirus/PhaME/results/Hantaan_virus_JS12_norepeats.fna
NUCMER

[P1]	[SUB]	[SUB]	[P2]	[BUFF]	[DIST]	[FRM]	[TAGS]
9	G	T	9	1	9	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10	A	T	10	1	10	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
12	T	.	11	2	11	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
16	.	A	16	4	16	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
20	T	A	20	4	20	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
215	G	A	215	195	215	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
2253	C	T	2253	106	2253	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
2359	A	C	2359	2	2359	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
2361	C	A	2361	2	2361	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
2396	C	A	2396	35	2396	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
4796	C	G	4796	1	4796	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
4797	G	C	4797	1	4797	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
5895	A	G	5895	181	5895	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
6076	C	T	6076	181	5768	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
6545	A	T	6545	21	5299	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
6566	T	G	6566	21	5278	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
6683	A	G	6683	81	5161	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
6764	A	G	6764	32	5080	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
6796	A	G	6796	32	5048	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
7091	G	C	7091	295	4753	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
7926	G	A	7926	207	3918	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
8133	T	C	8133	207	3711	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
8829	T	C	8829	179	3015	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
9008	A	G	9008	179	2836	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
9704	G	A	9704	370	2140	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10074	.	A	10075	0	1769	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10074	.	A	10076	0	1768	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10079	T	C	10081	5	1763	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10138	T	A	10140	46	1704	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10184	C	T	10186	46	1658	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10287	G	T	10289	25	1555	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10312	A	G	10314	9	1530	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10321	G	A	10323	9	1521	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11315	G	A	11317	226	527	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11541	G	A	11543	226	301	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11778	A	.	11779	1	65	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11779	A	.	11779	1	65	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11780	A	.	11779	1	65	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11781	A	.	11779	1	65	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11782	C	.	11779	1	64	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11783	T	.	11779	1	63	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11828	T	.	11823	18	18	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843