/users/218819/scratch/projects/HantaVirus/PhaME/results/Hantaan_virus_76_118_norepeats.fna /users/218819/scratch/projects/HantaVirus/PhaME/results/Hantaan_virus_cl_1_norepeats.fna
NUCMER

[P1]	[SUB]	[SUB]	[P2]	[BUFF]	[DIST]	[FRM]	[TAGS]
2359	A	C	2359	2	2359	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
2361	C	A	2361	2	2361	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
2506	T	C	2506	145	2506	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
3305	T	A	3305	799	3305	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
4796	C	G	4796	1	4796	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
4797	G	C	4797	1	4797	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
4905	A	C	4905	2	4905	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
4907	A	G	4907	2	4907	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
5014	C	T	5014	107	5014	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
5895	A	G	5895	181	5895	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
6076	C	T	6076	181	5770	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
6579	G	A	6579	104	5267	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
6683	A	G	6683	81	5163	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
6764	A	G	6764	81	5082	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
7091	G	C	7091	327	4755	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
7509	C	A	7509	271	4337	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
7780	C	T	7780	146	4066	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
7926	G	A	7926	146	3920	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
8133	T	C	8133	207	3713	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
8829	T	C	8829	696	3017	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
9704	G	A	9704	480	2142	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
10184	C	T	10184	128	1662	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
10312	A	G	10312	9	1534	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
10321	G	A	10321	9	1525	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
10373	G	T	10373	52	1473	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
11315	G	A	11315	226	531	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
11541	G	A	11541	226	305	1	1	Hantaan_virus_76_118_1_11845	Hantaan_virus_cl_1_1_11845
