/users/218819/scratch/projects/HantaVirus/PhaME/results/Hantaan_virus_cl_1_norepeats.fna /users/218819/scratch/projects/HantaVirus/PhaME/results/Hantaan_virus_JS12_norepeats.fna
NUCMER

[P1]	[SUB]	[SUB]	[P2]	[BUFF]	[DIST]	[FRM]	[TAGS]
9	G	T	9	1	9	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10	A	T	10	1	10	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
12	T	.	11	2	11	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
16	.	A	16	4	16	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
20	T	A	20	4	20	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
215	G	A	215	195	215	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
2253	C	T	2253	143	2253	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
2396	C	A	2396	110	2396	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
2506	C	T	2506	110	2506	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
3305	A	T	3305	799	3305	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
4905	C	A	4905	2	4905	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
4907	G	A	4907	2	4907	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
5014	T	C	5014	107	5014	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
6545	A	T	6545	21	5299	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
6566	T	G	6566	13	5278	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
6579	A	G	6579	13	5265	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
6796	A	G	6796	217	5048	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
7509	A	C	7509	271	4335	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
7780	T	C	7780	271	4064	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
9008	A	G	9008	1066	2836	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10074	.	A	10075	0	1769	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10074	.	A	10076	0	1768	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10079	T	C	10081	5	1763	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10138	T	A	10140	59	1704	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10287	G	T	10289	86	1555	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
10373	T	G	10375	86	1469	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11778	A	.	11779	1	65	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11779	A	.	11779	1	65	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11780	A	.	11779	1	65	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11781	A	.	11779	1	65	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11782	C	.	11779	1	64	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11783	T	.	11779	1	63	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
11828	T	.	11823	18	18	1	1	Hantaan_virus_cl_1_1_11845	Hantaan_virus_JS12_1_11843
